GOLD は，遺伝的アルゴリズムに基づいた，低分子がタンパク質の結合部位にどのようにドッキングするかを計算するプログラムです．リガンドおよびタンパク質の一部に分子の形の変化を取り込んでいます．IsoStar から取り入れられる水素結合の構造についての実験的情報を取り入れたエネルギー関数を使用しています．CSD からのねじれ角の分布データを利用しています．創薬の研究者に定評のあるドッキングプログラムです．

GOLD (分子設計ソフト) の概要

Genetic Optimisation for Ligand Docking： GOLD

製作	ケンブリッジ結晶学データセンター (Cambridge Crystallographic Data Centre: CCDC) ，Sheffield 大学および Glaxo SmithKline plc
頒布形態	CD，プログラムのダウンロード
使用可能機種	Windows PC, Linux
契約形態	ライセンス契約 (一般のみ保守契約あり, 大学割引あり)

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GOLD (分子設計ソフト) の特徴

PDB からの 305 のタンパク質−リガンド複合体に対して十分に検証されました． GOLD でトップにランクされた解答の 72％ が厳格な合致基準から判断して正確とわかりました． 最適化された遺伝的アルゴリズムパラメータは，バーチャルスクリーニングにも対応しております．

• 遺伝的アルゴリズム法を採用
• スコアは，GoldScore, ChemScore およびユーザの定義したものが使用可能
• プロセッサのネットワーク上の GOLD のパラレル化
• PC GRID, Linux クラスターにも対応
• ドッキング結果を解析表示する GoldMine と SILVER 付き