化学情報協会 総合カタログ 2017
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19科学データ情報室TEL:03-5978-3622 FAX:03-5978-3600E-mail:crystal@jaici.or.jpお問い合わせ先CCDC製品のアカデミック利用のご相談は,大阪大学蛋白質研究所までhttp://www.protein.osaka-u.ac.jp/csd/csd.html製品の種別利用者の対象契約ローカルインストールWeb研究者向け年間定額買取CD情報担当者向けタンパク質-リガンド複合体やその結合部位の構造理解に威力を発揮する,検索・表示・解析するツールです.社内サーバをお使いいただきますので機密性が保たれます.ご提供する PDB のデータに加え in-house の構造データを統合することが可能です.結晶学を熟知したCCDCならではの3次元検索機能,タンパク質-タンパク質相互作用や類似キャビティーの検索を始め,カスタマイズした検索が自由に行えます.検索結果の結合部位の重ね合わせ表示により,リガンドとタンパク質の exibility,リガンドや水分子の位置の解析が容易に行えます.製    作:ケンブリッジ結晶学データセンター(CCDC,英),Dr. M. Hendlich(Marburg大学,独)頒布形態:USB ハードディスク,追加データはダウンロード使用可能機種:サーバ側(Linux),クライアント側(Linux,Windows)契約形態:年間ライセンス契約(定額)タンパク質−リガンド・複合体検索ソフトRelibase+GOLD は,GA 法に基づいたタンパク質とリガンドのドッキングソフト.GOLD Suiteには構造の表示や加工を行う Hermes,ドッキング結果を解析するための GoldMineを備えています.ケンブリッジ結晶構造データベースのねじれ角の分布や分子間相互作用のパラメータなど豊富な実験データを考慮したエネルギー関数を使用しています.精密ドッキングからスクリーニングまで,創薬の研究者に定評のあるパッケージソフトです.多様な束縛条件,スコア関数には ChemPLP が追加され,Ensemble ドッキングやリスコアも可能です. 製    作:ケンブリッジ結晶学データセンター(CCDC,英),Sheeld 大学および GlaxoSmithKline plc(英)頒布形態:プログラムのダウンロード,USBメモリ使用可能機種:Linux,Windows PC,Mac OSX契約形態:年間ライセンス契約(定額)タンパク質−リガンド・ドッキングソフトGOLD Suite粉末回折パターンから結晶構造を決定するソフト.放射光ならびに実験室系X線回折から得た有機化合物や有機塩,溶媒含有化合物,無機物の回折パターンについて,指数付けから,結晶構造決定,リートベルト法による精密化まで,これひとつで一連の解析が行えます.実空間法を用いたスタンダードパッケージとして,広くご活用いただいております.製    作:ケンブリッジ結晶学データセンター(CCDC, 英), Prof. W. I. F. David(STFC, 英)and Dr. K. Shankland(Reading大学, 英)頒布形態:プログラムのダウンロード,USBメモリ使用可能機種:Windows PC契約形態:年間ライセンス契約(定額)粉末結晶構造解析ソフトDASHJAICI検 索IsoStarCSD と PDB のデータから抽出した非結合原子間相互作用のデータベース.注目している分子中心(central group)が官能基(contact group)とどのように相互作用しているかを分布として表示します.CSD-System に付属しています.MogulCSD のデータを元にした分子内ジオメトリーのデータベース.注目している分子の各部位(結合長,結合角,ねじれ角)を,同様の結合様式を持つ分子構造の実測値のヒストグラムとして表示します.CSD-System に付属しています.

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