JAICI からのお知らせ

2005 年 3 月 22 日 (火) SciFinderSTN 関連
REGISTRY ファイル - 核酸配列情報の注記コード追加
REGISTRY ファイルの核酸配列レコードに,置換基および化学修飾に関する注記コードが追加されました. 注記コードは /NTE フィールドで検索可能です.

今回追加された注記コードは,2005 年 1 月中旬以降に登録されたレコード中で使用されます.ただし,2005 年 1 月以前に登録されたレコードではこれらのコードを使用していませんので,検索の際はご注意ください.

   □ 追加された核酸配列情報の注記コード (NTE)

NTE フィールドの表記 定義 boc t-butyloxycarbonyl bu butyl ibu isobutyl sbu sec-butyl tbu tert-butyl cbz benzyloxycarbonyl cho formyl dnp 2,4-dinitrophenyl fmoc 9H-fluoren-9-ylmethoxycarbonyl pr propyl ipr isopropyl tms trimethylsilyl moe 2‘-O-(2-methoxyethyl) aza aza deaza deaza ethenyl ethenyl 2-propenyl 2-propenyl 1-propynyl 1-propynyl biotin-linked biotin-linked cyanine dye-linked cyanine dye-linked digoxigenin-linked digoxigenin-linked fluorescein-linked fluorescein-linked rhodamine-linked rhodamine-linked steroid-linked steroid-linked porphyrin-linked porphyrin-linked psoralen-linked psoralen-linked photoadduct photoadduct glycosylated glycosylated phosphonate phosphonate phosphorothioate phosphorothioate modified phosphate modified phosphate

□ レコード例

L1 ANSWER 1 OF 1 REGISTRY COPYRIGHT 2005 ACS on STN RN 821126-58-3 REGISTRY CN DNA, d(P-thio)([2‘-O-(2-methoxyethyl)]m5rU-[2‘-O-(2- methoxyethyl)]rG-[2‘-O- (2-methoxyethyl)]rG-[2‘-O-(2-methoxyethyl)]rG-[2‘-O-(2-methoxyethyl)] m5rC-T-T-G-G-m5C-m5C-m5C-A-T-A-[2‘-O-(2-methoxyethyl)]rA-[2‘-O-(2- methoxyethyl)]rG-[2‘-O-(2-methoxyethyl)]m5rU-[2‘-O-(2-methoxyethyl)]rG- [2‘-O-(2-methoxyethyl)]m5rU) (9CI) (CA INDEX NAME) OTHER NAMES: CN 578: PN: WO2005000202 SEQID: 577 claimed DNA CN ISIS 336007 NTE modified ---------------------------------------------------------------------- type ------ location ------ description ---------------------------------------------------------------------- modified base u-1 m5u modified base u-1 2‘-moe modified base g-2 2‘-moe modified base g-3 2‘-moe modified base g-4 2‘-moe modified base c-5 m5c modified base c-5 2‘-moe :省略

この他の配列情報に関する注記コードは,下記の資料をご覧ください.

Blocking Groups and Annotations for REGISTRY Sequences

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