JAICI からのお知らせ
2021 年 3 月 15 日 (月) | ![]() |
STNext - 配列検索のソート,フィルターの強化,ミスマッチ配列のハイライト強化
STNext は Classic STN のすべてのコンテンツにアクセスできるインターフェースです.
このたび,2021 年 2 月に STNext に搭載された新機能 「配列検索」 が更に使いやすくなりました.
◆ ソート項目の追加
ソート項目が追加され,以下の項目の降順または昇順で並べ替えできるようになりました.
· Alignment Identity % : 一致したコード÷類似領域×100
· Query Identity % : 一致したコード÷配列質問式×100
· Subject Identity % : 一致したコード÷回答配列×100
· Query Coverage % : 類似領域÷配列質問式×100
· Subject Coverage % : 類似領域÷回答配列×100
◆ ソート,フィルターの強化
配列検索の結果に適用したソートやフィルターが,他のページに移ったりログオフした後も保持されるようになりました.Motif 検索の場合,ヒットした配列毎に保持されます.
◆ ミスマッチ配列のハイライト
配列質問式とヒットした配列のアライメントで,ミスマッチしたコードが赤くハイライトされるようになりました.また,タンパク質の等価アミノ酸でヒットしたコードは黄色でハイライトされます.
尚,Excel 形式でダウンロードした際も,ハイライトは保持されます.
・例:核酸
・例:タンパク質
・Excel 形式でダウンロード
Biosequences の検索方法の詳細は STNext Biosequence 検索ガイドをご参照ください.
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