JAICI からのお知らせ

2021 年 3 月 15 日 (月) STN 関連
STNext - 配列検索のソート,フィルターの強化,ミスマッチ配列のハイライト強化

STNext は Classic STN のすべてのコンテンツにアクセスできるインターフェースです.

このたび,2021 年 2 月に STNext に搭載された新機能 「配列検索」 が更に使いやすくなりました.

◆ ソート項目の追加

ソート項目が追加され,以下の項目の降順または昇順で並べ替えできるようになりました.

· Alignment Identity % : 一致したコード÷類似領域×100
· Query Identity %   : 一致したコード÷配列質問式×100
· Subject Identity %  : 一致したコード÷回答配列×100
· Query Coverage %   : 類似領域÷配列質問式×100
· Subject Coverage %  : 類似領域÷回答配列×100

◆ ソート,フィルターの強化

配列検索の結果に適用したソートやフィルターが,他のページに移ったりログオフした後も保持されるようになりました.Motif 検索の場合,ヒットした配列毎に保持されます.

◆ ミスマッチ配列のハイライト

配列質問式とヒットした配列のアライメントで,ミスマッチしたコードが赤くハイライトされるようになりました.また,タンパク質の等価アミノ酸でヒットしたコードは黄色でハイライトされます.
尚,Excel 形式でダウンロードした際も,ハイライトは保持されます.

・例:核酸



・例:タンパク質



・Excel 形式でダウンロード

Biosequences の検索方法の詳細は STNext Biosequence 検索ガイドをご参照ください.

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