JAICI からのお知らせ

2021 年 12 月 3 日 (金) STN 関連
STNext - Biosequences Search への NCBI 由来の配列の追加と Motif 配列検索機能の強化

STNext は Classic STN のすべてのコンテンツにアクセスできる Web インターフェースです.

このたび STNext に搭載されている配列検索機能 Biosequences Search に下記の強化が行われました.

◆ NCBI 由来の配列の追加

Biosequences Search に NCBI 由来の配列が追加されました.
NCBI 由来の配列には, Subject タブに GenBank 登録番号が表示されます.
さらに,Get GenBank Accession Nos. ボタンが追加され,STN のデータベースで GenBank 登録番号を検索することができます.



Get GenBank Accession Nos. ボタンをクリックすると,データベースの選択をするポップアップが表示されます.Save Script にチェックを入れると,GenBank 登録番号の検索式をスクリプトとして保存することができます.
GenBank Accession Nos. ボタンによって検索できる GenBank 登録番号の上限は 5,000 件です.



◆ Motif 配列検索機能の強化

Biosequences Search の Motif 配列検索機能に Combine Motif Results オプションが追加されました.



従来の Motif 配列検索では,代替残基などの指定をした配列質問式を使用した場合,残基の組み合わせにより生じた配列質問式ごとに回答が表示されました.
Combine Motif Results オプションにチェックを入れて検索をすると,全ての組み合わせの回答を一度に表示することができます.

・ Combine Motif Results オプションチェックあり (デフォルト)



・ Combine Motif Results オプションチェックなし


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