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2022 年 1 月 21 日 (金) STN 関連
GENESEQ, PATGENE ファイル - 完全配列検索,部分配列検索に相補鎖検索オプション追加

GENESEQ ファイルは,世界 57 ヵ国の特許から抽出した核酸・タンパク質の配列およびその書誌情報を収録するデータベースです.
PATGENE ファイルは,世界知的所有権機関 (WIPO) に電子的に提出された核酸・タンパク質の配列およびその書誌情報を収録するデータベースです.

GENESEQ, PATGENE ファイルの完全配列検索,部分配列検索に相補鎖検索オプションが追加されました.

・相補鎖のオプション

核酸の完全配列,部分配列検索を行うと,デフォルトでは自動的に相補鎖が含まれます.
相補鎖を含めるかどうかはオプションで変更できます.

- SIN : 入力した配列コードのみの検索
- COM : 入力した配列コードの相補鎖のみを検索
- BOTH : 入力した配列コードとその相補鎖の両方を検索 (デフォルト)

・ 相補鎖オプションの指定方法

相補鎖オプションは  "-S コード" で指定してください.

<例>

=> FILE GENESEQ

=> RUN GETSEQ GCCCAAGCTGGCATCCGTCA/SQSN        ← デフォルトの BOTH (入力したコードと相補鎖) の検索

=> RUN GETSEQ GCCCAAGCTGGCATCCGTCA/SQSN -S SIN  ← 相補鎖オプションを SIN (入力した配列コードのみ) に変更
                                                         
=> RUN GETSEQ GCCCAAGCTGGCATCCGTCA/SQSN -S COM  ← 相補鎖オプションを COM (入力した配列コードの相補鎖のみ) に変更

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