JAICI からのお知らせ

2007 年 9 月 13 日 (木) STN 関連
DGENE ファイル - 新規データが追加されました

DGENE ファイルは特許由来の配列情報を収録する配列データベースです.

このたび,2007 年 7 月 26 日以降 (ダウエントアップデート 200715 以降)に更新されたレコードから,キーワード (/KW),クロスレファレンス (/CR),および抄録 (/AB) フィールドに,新しい情報が追加されるようになりました.

・クロスレファレンス (/CR) フィールド

    NCBI および UniProt のデータベース由来の配列データにはクロスレファレンスフィールドに,「PC-」 または 「PC_ENCPRO-」 から始まる識別子で表示されるようになりました.
    例   PC-NCBI : gi12669911 (gi12669911 が NCBI データベースのレコード番号)

    トムソンサイエンティフィック社の生物学的相互作用データベース 「BINDplus」 に含まれるデータについては,「PC-BIND」 から始まる識別子で表示されるようになりました.
    例   PC-BIND: 71005;80040  (71005;80040 が BINDplus データベースのレコード番号)

・キーワード (/KW) フィールド

    Gene Ontology タームなどの情報がキーワードフィールドに追加されました.これらの情報は,「BOND_BC」 から始まる識別子で表示されます.
    例   BOND_PC; GO3713; GO5634; GO5737; GO6355; GO30528; GO45941)

・抄録 (/AB) フィールド

    レコードの修正日とその内容が抄録フィールドに表示されます.

■レコード例

AN    AGD59107  protein       DGENE
TI    New combination comprising a first conjugate and a second conjugate,
      useful in modifying immune cells to generate or enhance an immune
      response to a tumor expressing a tumor-associated antigen or to an
      infectious agent.
IN    Shirwan H; Elpek K G; Yolcu E S
PA    (UYLO-N)    UNIV LOUISVILLE RES FOUND INC.
PI    WO 2007067681   A2 20070614               139
AI    WO 2006-US46662      20061207
PRAI  US 2005-748177P      20051208
      US 2006-771179P      20060206
      US 2006-799643P      20060512
      US 2006-863173P      20061027
PSL   Disclosure; SEQ ID NO 13
DED   25 JUL 2007  (revised); 09 AUG 2007  (first entry)
DT    Patent
LA    English
OS    2007-468950 [45]
CR    PC-NCBI: gi9627105     ← 追加された情報
      PC-SWISSPROT: P03129
      PC-BIND: 153381    ← 追加された情報
DESC  Tumor-associated antigen, HPV16 early protein E7.
KW    early protein; E6; vaccine; therapeutic; adenovirus infection;
         :
      streptococcus pneumoniae infection; togavirus infection; uterine cervix
      tumor; viral infection; virucide; western equine encephalitis virus
      infection; BOND_PC; GO3677; GO3700; GO5515; GO5622; GO6350; GO6355.  ← 追加された情報
ORGN  Human papillomavirus type 16.
AB    The invention provides conjugates comprising an immune co-stimulatory
      polypeptide and an antigen or infectious agent. 
        :
      The  immunostimulatory moieties are useful
      in the context of vaccines, cancer  immunotherapy, and in the treatment
      of immune-based disorders. The  sequence presented is the
      tumor-associated antigen, HPV16 early protein  E7.  Revised record issued on 
     25-JUL-2007 : Enhanced with precomputed  information from BOND. ← 追加された情報
AA    3 A; 3 R; 2 N; 10 D; 0 B; 7 C; 5 Q; 9 E; 0 Z; 5 G; 4 H;  5 I; 11 L; 2 K;
      3 M; 1 F; 6 P; 5 S; 9 T; 0 W; 4 Y; 4 V;  0 Others
SQL   98
SEQ
        1 mhgdtptlhe ymldlqpett dlycyeqlnd sseeedeidg pagqaepdra
       51 hynivtfcck cdstlrlcvq sthvdirtle dllmgtlgiv cpicsqkp  
 
 
  
FEATURE TABLE:
Key       |Location|Qualifier|                       
==========+========+=========+=======================
Region    |49..57  |note     |"Epitope"              
 

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