JAICI からのお知らせ

2010 年 6 月 23 日 (水) STN 関連
DGENE, PCTGEN, USGENE ファイル - バッチ検索の強化

DGENE, PCTGEN, USGENE ファイルは,特許中の配列情報を収録するデータベースです.

これらのファイルで,2010 年 6 月 21 日より完全配列・部分配列 (RUN GETSEQ) に対してバッチ検索が利用可能になりました.
(従来はホモロジー検索 (RUN BLAST, RUN GETSIM) のみバッチ検索が可能でした.)

    * バッチ検索とは,配列質問式をシステムに登録しておき,コンピュータの利用の少ない時間帯にホモロジー検索を実行させ,回答を後から入手する検索方法です.

◆ 完全配列・部分配列のバッチ検索方法

=> RUN GETSEQ コード/検索フィールド BATCH
PLEASE ENTER BATCH IDENTIFIER (MAX. 8 CHARS):注文名

TO BE NOTIFIED WHEN THIS BATCH SEARCH IS COMPLETE, 
PLEASE ENTER YOUR EMAIL ADDRESS (MAX. 50 CHARS) OR "NONE"
INPUT: OR (END):メールアドレス

* メールアドレスを入力しますと,バッチ検索の終了をお知らせするメールが届きます.
このメールでのお知らせは,ホモロジーバッチ検索でも利用できるようになりました.

◆ 検索例

(1) バッチ検索を注文します.

=> FILE DGENE

=> RUN GETSEQ GTCCAGGAGCAGGTAGCTGCTGGGCTCCGG/SQSN BATCH

PLEASE ENTER BATCH IDENTIFIER (MAX. 8 CHARS):TEST

TO BE NOTIFIED WHEN THIS BATCH SEARCH IS COMPLETE, 
PLEASE ENTER YOUR EMAIL ADDRESS (MAX. 50 CHARS) OR "NONE"
INPUT: OR (END):SUPPORT@JAICI.OR.JP

RUN GETSEQ AT 02:49:41 ON 23 JUN 2010
COPYRIGHT (C) 2010 FIZ KARLSRUHE GMBH

BATCH PROCESSING STARTED FOR TEST   

=> LOG Y (または LOG H)


(2) バッチ検索が終了しますと,(1) で入力したメールアドレス宛に検索終了の通知が届きます.

DGENE TEST BATCH GETSEQ SEARCH RESULTS ARE READY FOR COLLECTION. PLEASE LOG BACK IN TO STN, AND USE 
THE RUN GETBATCH COMMAND IN FILE DGENE TO COLLECT YOUR SEARCH RESULTS.

THIS IS AN AUTOMATICALLY GENEREATED EMAIL. 
FOR MORE INFORMATION PLEASE CONTACT HelpDesk@Fiz-karlsruhe.de 


(3) バッチ検索結果の入手

=> FILE DGENE

=> RUN GETBATCH
Please enter your batch identifier
    or enter # for batch id list
    or enter * for batch id at top of list
    or enter - before batch id to delete
    or enter . for (end)
BATCH REQUEST:#
Batch result files remaining:
  TEST       Completed (getseq) 
-----------------------
Please enter your batch identifier
    or enter # for batch id list
    or enter * for batch id at top of list
    or enter - before batch id to delete
    or enter . for (end)
BATCH REQUEST:TEST

RUN GETSEQ AT 02:50:29 ON 23 JUN 2010
COPYRIGHT (C) 2010 FIZ KARLSRUHE GMBH

L3    RUN STATEMENT CREATED
L3          11 GTCCAGGAGCAGGTAGCTGCTGGGCTCCGG/SQSN

◆ 完全配列・部分配列 (RUN GETSEQ) のバッチ検索料金

   初期料金  検索結果回収料金  
 DGENE ファイル  1,350 円  4,500 円
 PCTGEN ファイル    658 円  2,142 円
 USGENE ファイル    929 円  3,231 円


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