GOLD Suite (タンパク質-リガンド・ドッキングソフト) 概要

概要・収録内容
GOLD Suite (タンパク質-リガンド・ドッキングソフト) の概要
Genetic Optimisation for Ligand Docking: GOLD 5.4
製作 ケンブリッジ結晶学データセンター (The Cambridge Crystallographic Data Centre: CCDC) ,Sheffield 大学および GlaxoSmithKline 社 (英)
頒布形態 ダウンロードまたはUSBメモリ
使用可能機種 Windows (32 ビット,64ビット) Vista/7/8/10
Linux (32ビット,64ビット)
   - RedHat Enterprise 6, 7
   - CentOS 6, 7
   - Ubuntu 12, 14, 16
Mac OS X 10.9, 10.10, 10.11, 10.12
契約形態 年間定額 (4月~3月)
(2016年度より,アカデミック向けには,CSD-Enterpriseとして蛋白質研究所より配布)

● 詳細はこちらをご覧ください.

機能紹介

PDB からの 305 のタンパク質-リガンド複合体に対して十分に検証されました. GOLD でトップにランクされた解答の 72%が厳格な合致基準から判断して正確とわかりました. 最適化された遺伝的アルゴリズムパラメータは,バーチャルスクリーニングにも対応しております.

マニュアルなど

GOLD の資料を閲覧いただけます.
CCDC の提供する documentation (pdf,英文)

アカデミック利用の方へ

大学・教育機関向けには,CSD-Enterprise として大阪大学蛋白質研究所から配布しております. アカデミック・ライセンスについてのお問い合わせ,お申し込みは下記へお願いいたします.

〒565-0871
吹田市山田丘3-2
大阪大学蛋白質研究所
附属蛋白質解析先端研究センター
蛋白質データベース開発研究室系
中野 眞理子 様
TEL : 06-6879-4311
FAX : 06-6879-8636

(大阪大学蛋白質研究所)
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未定