GOLD (タンパク質－リガンド・ドッキングソフト) 概要
概要・収録内容
GOLD (タンパク質－リガンド・ドッキングソフト) の概要
Genetic Optimisation for Ligand Docking： GOLD 5.6| 製作 | ケンブリッジ結晶学データセンター (The Cambridge Crystallographic Data Centre: CCDC) ，Sheffield 大学および GlaxoSmithKline 社 (英) |
| 頒布形態 | ダウンロード (オプションでUSBメモリー) (CSD 2018) |
| 使用可能機種 | Windows (32 & 64 bit) 7, 8, 10 Linux (32 & 64 bit) - RedHat Enterprise 6 and 7 - CentOS 6 and 7 - Ubuntu 12, 14 and 16 Mac OS X 10.10, 10.11, 10.12, 10.13 |
| 契約形態 | 年間定額 (4月～3月） CSD-Discovery および CSD-Enterprise に付属します． |
● 詳細はこちらをご覧ください．
機能紹介
バーチャルスクリーニング，リード最適化，活性分子の結合モードの同定にご活用いただけます．CSD の実測データを使ったパラメータを使っており，望ましくないリガンド配座を排除することで，Asetx Diverse セット (85) を使った検証では，81% が RMDS < 2.0 Å に収まっています．
- 遺伝的アルゴリズム法を採用
- 幅広いスコア関数：GoldScore, ChemScore, Astex Statistical Potential, CHEMPLP およびユーザが定義したもの
- アンサンブルドッキングに対応
- クラスターマシンにも対応
マニュアルなど
GOLD の資料を閲覧いただけます.
- CSD パッケージソフト資料一覧
- CCDC の提供する documentation (pdf，英文)
アカデミック利用の方へ
大学・教育機関向けには，CSD-Enterprise として大阪大学蛋白質研究所から配布しております. アカデミック・ライセンスについてのお問い合わせ，お申し込みは下記へお願いいたします.
〒565-0871
吹田市山田丘3－2
大阪大学蛋白質研究所
附属蛋白質解析先端研究センター
蛋白質データベース開発研究室系
下家 和子 様
TEL ： 06-6879-8605
FAX ： 06-6879-8606
イベントのお知らせ
学会出展やイベント協賛のお知らせです. 出展会場では，リーフレットの配布やデータベースのデモを行っておりますので，お気軽にお立ち寄りください.