GOLD Suite (タンパク質－リガンド・ドッキングソフト) 概要
概要・収録内容
GOLD Suite (タンパク質－リガンド・ドッキングソフト) の概要
Genetic Optimisation for Ligand Docking： GOLD 5.4| 製作 | ケンブリッジ結晶学データセンター (The Cambridge Crystallographic Data Centre: CCDC) ，Sheffield 大学および GlaxoSmithKline 社 (英) |
| 頒布形態 | ダウンロードまたはUSBメモリ |
| 使用可能機種 | Windows (32 ビット，64ビット) Vista/7/8/10 Linux (32ビット，64ビット) - RedHat Enterprise 6, 7 - CentOS 6, 7 - Ubuntu 12, 14, 16 Mac OS X 10.9, 10.10, 10.11, 10.12 |
| 契約形態 | 年間定額 (4月～3月） (2016年度より，アカデミック向けには，CSD-Enterpriseとして蛋白質研究所より配布) |
● 詳細はこちらをご覧ください．
機能紹介
PDB からの 305 のタンパク質－リガンド複合体に対して十分に検証されました． GOLD でトップにランクされた解答の 72％が厳格な合致基準から判断して正確とわかりました． 最適化された遺伝的アルゴリズムパラメータは，バーチャルスクリーニングにも対応しております．
- 遺伝的アルゴリズム法を採用
- スコアは，GoldScore，ChemScore，ChemPLP およびユーザーの定義したものが使用可能
- プロセッサのネットワーク上の GOLD のパラレル化
- Linux クラスターにも対応
- ドッキング結果を解析表示する GoldMine 付き
マニュアルなど
GOLD の資料を閲覧いただけます.
・CCDC の提供する documentation (pdf，英文)
アカデミック利用の方へ
大学・教育機関向けには，CSD-Enterprise として大阪大学蛋白質研究所から配布しております. アカデミック・ライセンスについてのお問い合わせ，お申し込みは下記へお願いいたします.
〒565-0871
吹田市山田丘3－2
大阪大学蛋白質研究所
附属蛋白質解析先端研究センター
蛋白質データベース開発研究室系
中野 眞理子 様
TEL ： 06-6879-4311
FAX ： 06-6879-8636
イベントのお知らせ
学会出展やイベント協賛のお知らせです. 出展会場では，リーフレットの配布やデータベースのデモを行っておりますので，お気軽にお立ち寄りください.