Full Interaction Maps
化合物表面の相互作用マップ生成プログラム
Full Interaction Mapsは、ケンブリッジ結晶構造データベース(CSD)とProtein Data Bank (PDB)の結晶構造情報に基づき、化合物表面の相互作用を予測し可視化するプログラムです。標的タンパク質に対する相互作用や、結晶中の分子間相互作用を理解するのに役立ちます。
CSD-Discovery 、CSD-Materials および CSD-Enterprise に付属しています。
Full Interaction Mapsには、どのような特徴がありますか？
実験データに基づく知識ベースの予測
Full Interaction Mapsは、CCDCの分子間相互作用ライブラリであるIsoStarからデータを取得しています。
IsoStarには、CSDとPDBの相互作用情報が含まれており、knowledgeベースの相互作用マップが作成されます。
ホットスポットの特定
青は潜在的な水素結合ドナーが位置する場所を示し、赤はアクセプター、オレンジは芳香族相互作用を示します。これらは密度マップとして可視化され、分子表面のホットスポットの特定が可能になります。
Full Interaction Mapsは、どのような場面で用いられますか？
Full Interaction Mapsは、分子表面の相互作用マップを生成し、ホットスポットを可視化することにより、以下を可能にします。
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