主な技術強化と改良点

2025年の強化点 (CSD 2025.3)

• GOLDにおいて、CCD(Chemical Component Dictionary) fileの読み込み、mmCIF形式でのoutput file出力が可能に

• CSD-Materialsにおいて、Mercury内でAutoFIDELを使用し、実験PXRDデータにおいて結晶構造の最適化が可能

• CSD-Materialsにおいて、MercuryとCSD Python APIにおいて、結晶成長に関連する結晶構造内のPeriodic Bond Chain(PBC)を検出して可視化

• Mercuryで、CSD Python API→Prototypesから次のスクリプトが利用可能に

  ・High Z prime Hydrogen Bond Propensity：非対称単位に複数の分子を含む構造に対してHydrogen Bond Propensityを実行

  ・Interaction Analysis：共結晶作成分子候補をランキング形式でレポート出力。

  ・Void Network：対象構造内の詳細なvoid情報を入手。［CSD-Frameworksの契約でも利用

2025年の強化点 (CSD 2025.2)

• CSD-Materialsにおいて、様々な力場を用いて結晶・分子構造を最適化するCrystal/Molecule Optimizerが新規追加

• CSD-Particleにおいて、VisualHabit用の力場にthe Cambridge Structural Database-Optimized Potential for Crystal Structures 2016 (CSD-OPCS16)が追加

2025年の強化点 (CSD 2025.1)

• 新データベース・フォーマットに変更し、data fieldが更に充実

• MOFのtotal surface area, geometric volume等が追加 (13.5万件に対応済)

• Disorderの表示機能を強化 (位置のみが表示されていたdisorder原子を結合も含めて表示 / 16.5万件に対応)

• CSD-Discoveryにおいて、GOLDのcovalent docking機能を強化 (反応性基と標的タンパク質が自動的に共有結合を形成)

• CSD-Discoveryにおいて、 Ligand OverlayがCSD Python APIで利用可能

• CSD-Materialsにおいて、実験で得られたPXRDパターンとCSD内のデータから計算されたシミュレーションパターンをMercury上で比較可能

• CSD-Particleにおいて、VisualHabitにCLP力場を追加