化学情報協会

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STNext - Biosequences メニューの強化

2021年4月12日(月)

STNext

STNext は Classic STN のすべてのコンテンツにアクセスできるインターフェースです。

このたび、STNext の Biosequences メニューが強化され、配列質問式のチェック機能が追加されました。

不正な質問式を入力すると、検索前する前に警告が表示され、質問式を修正できるようになりました。

検索可能な配列質問式の形式は下記の通りです。
  • BLAST 検索:プレーンテキスト形式、EMBL 形式、GenBank 形式、FASTA 形式
  • CDR 検索:FASTA 形式
  • モチーフ検索:プレーンテキスト形式
配列質問式中に使用できる文字・記号は下記の通りです。
  • BLAST、CDR 検索:A~Z または a~z のアルファベットと 0~9 の数字
  • モチーフ検索:A~Z または a~z のアルファベットと 0~9 の数字および下記の記号
    {}
    []
    ^$
    ,
    .

 注意:^$ は必ずセットで使用してください。例: ^AAAAAAAAAAAAAA$