化学情報協会

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GENESEQ, PATGENE ファイル - ホモロジー検索 (BLAST, GETSIM) 結果の回収オプションの追加

2022年2月14日(月)

STNext

GENESEQ ファイルは、世界 57 ヵ国の特許から抽出した核酸・タンパク質の配列およびその書誌情報を収録するデータベースです。
PATGENE ファイルは、世界知的所有権機関 (WIPO) に電子的に提出された核酸・タンパク質の配列およびその書誌情報を収録するデータベースです。

このたび、GENESEQ, PATGENE ファイルで、ホモロジー検索 (BLAST, GETSIM) を実行した際の回答の回収オプションの種類が増えました。
指定できるオプションの種類は下記の 5 つです。

 - 回答全件 (ALL と入力)
 - 入手したいスコア値の最低値 (数字を入力)
 - 入手したいスコア値パーセント (スコア値/最高スコア値) の最低値 (入力例:85% または 85% SCORE)
 - 入手したい同一性パーセント (一致コード数/Alignment コード数) の最低値 (入力例:100% IDENT)
 - 入手したいスコア値パーセントの最低値と同一性パーセントの最低値 (入力例:85% SCORE 100% IDENT)

入力方法については、USGENE ファイルリロードのお知らせをご参照ください。