STNext - 新機能「配列検索」「Bioscape」リリース

 3 つの配列検索プログラム

BLAST ホモロジー検索、相補性決定領域 (CDR) 配列検索、モチーフ配列検索プログラムが利用できます。

• BLAST ホモロジー検索 - 局所的に類似した配列を検索するプログラム
  検索タイプ BLASTn, BLASTp, tBLASTn, BLASTx を利用できます。
• CDR 配列検索 - 抗体と T 細胞受容体の CDR を指定し検索するプログラム
• Motif 配列検索 - DNA, RNA, タンパク質中の短いパターン配列を検索するプログラム 

BLAST 配列結果画面例

CDR 配列検索結果画面例

検索結果には、アライメントの表示や配列の由来となる特許情報も併せて表示され、Identity% などによる絞り込みも可能です。
また、結果は Excel 形式でダウンロードができます。

得られた配列の由来となる特許情報は、検索結果画面に表示される 「Get from STN File」 および 「Get All from STN File」 をクリックすると CAplus ファイルや他の特許全文データベースに簡単にクロスオーバーでき特許の詳細を確認できます。

収録源

このたび搭載された 「配列検索」の収録源は、CAS が独自のルールに従い収集した REGISTRY ファイルの配列データに加え、7 つの主要特許発行機関 (US, EP, WO, CA, KR, JP, CN) の特許から抽出した配列データが追加されています。

• 60 以上の特許発行機関の約 110 万件の特許から収録された約 5 億 8,000 万件の配列が含まれます。
• 電子的に提出された配列表や他のデータベースで見つけることが難しい配列も収録されています。
• 約 1,000 万件の CDR を含む抗体や T 細胞受容体の配列も含まれます。

配列検索結果の解析機能 Bioscape の搭載

上記でご紹介した新機能「配列検索」で得られた結果に対して、配列の類似性により解析できる Bioscape が搭載されました。
マップ内には関連特許の件数が 3D で示されるため配列関連特許を視覚的に分かりやすく解析することができます。

Biosequences の検索方法および Bioscape 作成手順の詳細は STNext Biosequence 検索ガイドをご参照ください。

このたび搭載された配列検索、Bioscape のご利用について

• 包括契約 (STN IP Protection Suite) でご利用のお客様：すぐにご利用いただけます。
• STN を定額でご利用のお客様：オプション契約でご利用いただけます。
• STN を従量制でご利用のお客様：すぐにご利用いただけます

ご興味のある方は、社内の契約担当の方にご相談の上、「お問い合わせ」の「情報事業部」よりお問合せください。