化学情報協会

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CAS STNext - CAS Biosequences の検索上限の増加など

2022年11月22日(火)

STNext

CAS STNext で下記の強化が行われました。

CAS Biosequences の検索上限の増加

これまで CAS Biosequences の BLAST, CDR, Motif 配列検索の検索上限は 20,000 件以内で選択する方式でしたが、このたび、すべての検索で検索上限が 100,000 件に増加しました。
この強化にともない、これまであった検索上限の選択項目(Limit Total Sequence Results to)がなくなりました。

ファイルインポート・保存時のメッセージの変更

My Files の Structures ページおよび Scripts ページにある既存のファイルと同じファイル名の構造質問式や配列質問式、スクリプトをインポートまたは保存しようとすると、「File name already exists in this location.」というメッセージが表示されるようになりました。
Replace ボタン、Rename ボタン、Cancel ボタンがあり、Replace を選択すると既存ファイルを新しいファイルで上書きします。Rename を選択するとファイル名を変更してインポートまたは保存ができます。
また、複数ファイルを一度にインポートしようとした場合で複数ファイルが既存ファイルと同じファイル名だった場合、ファイルごとに上書きするか名前を変更するか決めることができます。

Generate FragCode Script 機能の強化(ダウエント会員のみ)

2022 年 3 月 18 日のニュースでお知らせしたとおり、CAS STNext では構造質問式からケミカルフラグメンテーションコード (ケミカルコード) による検索式を自動作成することができます。(Generate FragCode Script 機能)

このたび、この機能が強化され、自動作成されるスクリプトにコードの説明が含まれるようになりました。
自動作成されるスクリプトの下方に FragCode Descriptions の項目が新たに含まれるようになり、ここにコードの説明が記載されます。なお、この FragCode Descriptions 以下は検索式としては実行されず、セッション画面にも表示されません。

例)
\* FragCode Descriptions
\* F013 - MONO-HETEROCYCLE - SUBSTITUTED AT POSITION 3
\* F014 - MONO-HETEROCYCLE - SUBSTITUTED AT POSITION 4
\* F431 - 6-MEMBERED MONO-HETEROCYCLE WITH 1 N:- (C5H5N); PYRIDINE
\* G010 - 1 POSITION SUBSTITUTED on UNFUSED BENZENE
\* G100 - 1 OR MORE UNCONDENSED BENZENES with no other carbocycles present
\* H1 - SET H1: AMINE ESSENTIAL
\* H2 - SET H2: RING TERTIARY NITROGEN ESSENTIAL
:

K220 などの旧コードは関連するコードの横に括弧で表示されます。
例)\* K221(K220) - ORGANIC S-S-(S)n GROUP (n>1)

* Generate FragCode Script メニューはダウエント会員以外は表示されません。
* 会員用ファイルやケミカルコードの詳細については Clarivate にお問い合わせください。

詳細は CAS STNext Help の What's New > November 17, 2022 をご覧ください。